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经过两天修改使用终于完成af3的安装以及样例测试。

！在clone之前可以看一下自己的编译版本比如：gxx_linux-64和gcc_linux-64 如果不行就利用conda更新

conda install gxx_linux-64 gxx_impl_linux-64 gcc_linux-64 gcc_impl_linux-64=13.2.0 -c conda-forge

可以参考链接: AlphaFold3 conda环境下部署

第一步：创建af3环境

先创建af的env环境，然后可以利用上述语句进行更新编译版本

#create conda env
conda create -n af python=3.11
conda activate af3

第二步：从git中clone alphafold3.git以及pip install相关

git clone https://github.com/google-deepmind/alphafold3.git
cd alphafold3
conda install -c bioconda hmmer
pip install -r dev-requirements.txt
pip install . --no-deps -